Expression de la protéine PGBD5 - EPHE - École pratique des hautes études Access content directly
Master Thesis Year : 2020

Expression de la protéine PGBD5

Abstract

Les éléments transposables (ET) sont une source importante de mutations dans tous les génomes eucaryotes. Au sein de chaque espèce, les ET co-évoluent avec leur environnement et le génome de leurs hôtes pouvant conduire à la récupération par l’hôte d’éléments fonctionnels appartenant à l’ET. Ce processus de domestication permet ainsi parfois la création de nouveaux gènes pour l’hôte. Cinq des 54 néogènes connus chez l’Homme codent des transposases toujours actives : SETMAR, RAG1-RAG2, THAP9 et PGBD5. La protéine PGBD5 est une transposase très conservée chez les vertébrés, exprimée de façon ubiquitaire dans le Système Nerveux Central (SNC) et plus fortement dans les neurones dits pyramidaux et granulaires de l'hippocampe, l'amygdale, du bulbe olfactif et du cervelet chez un individu sain. Elle est capable in vitro de catalyser des réarrangements génomiques locaux dans les neurones ce qui pourraient participer à la mémorisation. La protéine PGBD5 est également sur-exprimée dans la plupart des tumeurs solides chez les enfants et est retrouvée dans les liquides corporels tels que le sérum plasmatique et le liquide cérébro-spinal avec un taux très supérieur en cas de cancers. Cependant, l’absence d’anticorps anti-PGBD5 validés empêche pour le moment l’utilisation de la protéine PGBD5 en tant que bio-marqueur de diagnostic pour les maladies neurodégénératives et les cancers. Dans le cadre de ce travail, nous avons essayé : i) de déterminer les sites d’expression de la protéine en caractérisant un sérum anti-PGBD5 capable de détecter la protéine en Western Blot et immunocytochimie, ii) de localiser les sites de liaison de la protéine PGBD5 vis-à vis des PiggyBac-like elements (pbles) sur l’ADN par une approche de ChIP-séquençage et iii) de vérifier la capacité de transposition de la protéine PGBD5 à l’aide d’un test de transposition et de la méthode de LAM-PCR. Les résultats présentés dans ce manuscrit ont pour but d’éclairer sur le ou les rôles physiologiques potentiels de la protéine PGBD5 et de décrypter la fonction de la protéine PGBD5 dans un noyau des cellules eucaryotes.
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hal-03597097 , version 1 (04-03-2022)

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Attribution - NonCommercial - NoDerivatives

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  • HAL Id : hal-03597097 , version 1

Cite

Linda Beauclair. Expression de la protéine PGBD5 : Où ? Quand ? Comment ?. Sciences du Vivant [q-bio]. 2020. ⟨hal-03597097⟩
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